Ngày 3 tháng 12 năm 1958, Bộ Nội vụ ban hành Nghị định 162-NV. Theo đó, tách một phần diện tích và dân số của các xã Lưu Phượng, Thượng Kiệm và Kim Chính để thành lập thị trấn Phát Diệm.[3]

Đến năm 2019, xã Kim Chính có diện tích 7,23 km², dân số là 7.363 người, mật độ dân số đạt 1.018 người/km², gồm 11 xóm.[4]

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 861/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc tỉnh Ninh Bình (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 2 năm 2020)[2]. Theo đó, sáp nhập toàn bộ 1,33 km² diện tích tự nhiên và 1.335 người thuộc 3 xóm: 1, 2, 3 của xã Yên Mật vừa giải thể vào xã Kim Chính.